FVBU är en ideell förening.
Huvudstyrelsen, beslutar enligt stadgarna om föreningens fastigheter och tillgångar, förvaltar testamentariska förordnanden och donationer samt tillser att barnen och ungdomarna får den vård och fostran som föreningen avser att bereda dem. Huvudstyrelsen beslutar om tillsättande av director och andra ledande befattningar inom föreningen. Huvudstyrelsens uppdrag är också att genomföra årsmötets beslut. Huvudstyrelsen sammanträder i samband med föreningens årsmöte samt ytterligare två till tre gånger per år.
Director - Föreningens director ska leda föreningens verksamhet och har ansvar för verkställandet av årsmötets och huvudstyrelsens beslut. Directorn är föreningens huvudkassör, chef för föreningens personal och ansvarig för utformning av dess arbetsuppgifter och arbetsmiljö. Det åligger också directorn att utöva tillsyn över lokalavdelningarnas verksamhet.
Medlem kan den bli som är intresserad av föreningens syften.
Föreningen håller i april månad varje år sitt riksårsmöte där anmälda medlemmar fastställer planer avseende verksamhet och ekonomi för kommande verksamhetsår. Årsmötet beviljar, efter genomgång av föreningens förvaltningsberättelse, ekonomiska redogörelse och revisionsberättelse, styrelsen och directorn ansvarsfrihet.
Föreningen har beslutsrätt över verksamhet och ekonomi men avger årligen en rapport till Metodistkyrkan i Sverige.
FVBU:s förskolor - enligt Skollagens krav finns en ansvarig förskolechef som är pedagogisk ledare och ansvarig för förskolans organisation. Förskolechefen har ekonomiskt och arbetsmiljöansvar enligt delegation från FVBU:s director.
Directorn har det övergripande ansvaret.